酵母菌

方法
運用酵母菌窺見人工智慧的黑盒子

運用酵母菌窺見人工智慧的黑盒子

運用酵母菌窺見人工智慧的黑盒子
編譯/中研院資科所博士後研究員 黃佳欣

現今許多人工智慧系統所應用的深度神經網路(Deep neural network, DNN)還是有些神秘,機器內部的運作往往就像是個黑盒子。一篇發表在 Nature Methods 期刊上的研究論文,來自加州大學聖地亞哥分校的團隊開發出一套「可視化神經網路」(visible neural network, VNN)模型,他們把酵母菌的基因等分子階層網路映射到深度神經網路的基本架構,讓研究人員能夠觀察人工智慧系統的運作情況,並透過機器洞察細胞的內部運作,由此產生的技術期待未來可以尋求新的抗癌藥物或是應用在個人化治療。

酵母菌什麼時候才會進行酒精醱酵?

酵母菌 (yeast) 什麼時候才會進行酒精發酵 (alcohol fermentation)?
長庚大學生命醫學系周成功教授/長庚大學生命醫學系周成功教授責任編輯

太陽是現今生物世界中能量的源頭,那些能行光合作用的生物,可以將太陽的光能轉變成生物能,將二氧化碳轉化成醣類分子。不能行光合作用的生物就只有直接抑賴那些行光合作用的生物作為能量(食物)的來源。當生物吃下食物後,儲存在食物分子中的能量,也必須經過分解代謝的過程,才能轉換成生物世界中能夠使用的能量。

地球上所有的生命形式,從細菌到人,都使用完全一樣的能量貨幣:ATP!ATP在體內水解時會放出能量。這個能量的額度固定,大小適中,剛好可以應付生命中進行各種不同化學反應所需要的能量(圖一)。除了ATP之外,食物分子分解代謝往往還會產生另一種能量貨幣:儲存在NADH分子中的高能量電子(圖二)。要說明生物如何從事能量轉換最好的例子就是葡萄糖分解,因為從細菌到人都是利用完全相同的一套反應來進行。

圖一:ATP的結構與水解的過程