南方墨點法與北方墨點法

南方墨點法 (Southern hybridization) 與北方墨點法 (Northern hybridization)
國立臺灣師範大學生命科學系碩士生何懿洲

南方墨點法 (Southern blot) 是由英國生物學家Sir Edwin Southern發明，並因此得名（Southern為南方之意），是一種十分常用的分子生物學實驗技術。其用途是利用基因探針去偵測由膠體電泳分離出來的DNA片段，以搜尋到含有特定序列的DNA片段。

北方墨點法是由史丹佛大學的James Alwine and George Stark所發明，將所要偵測的樣本DNA片段改為RNA片段，而之所以稱為北方墨點法是因為先有「南方」墨點法，接下來發明的墨點法仍以方位命名，例如繼北方墨點法之後又有西方墨點法(Western blot)，它們皆與實際方位無關。

南方墨點法是利用標記的探針（probe）與轉印至膜上的標靶DNA片段進行雜交，來檢測標靶DNA片段中是否存在與探針同源的序列。雜交過程是利用DNA分子的高度特異性,可以根據所使用的已知序列探針進行特異性的標靶DNA片段檢測。

先利用膠體電泳分離DNA樣本中各種不同大小的序列片段。不同大小的序列片段在膠體電泳之後，會因分子量大小不同而分佈在膠體上不同的位置。並將膠體上分離過後的DNA序列片段轉印到一個薄膜上，接著經由DNA變性使它們的雙股分開。

然後將上述薄膜暴露在雜交探針（probe）裡，探針是已被標記會產生放射線、或可以放出顏色或螢光物質的單股DNA或核糖核酸（RNA）片段，讓探針和DNA雜交（hybridize）。最後是觀察結果，薄膜上可以偵測到放射性或者螢光訊號的位置，就是含有可以與探針核酸序列進行偶合的DNA。

北方墨點法Northern hybridization是利用標記的探針（probe）與轉印膜上標靶RNA片段進行雜交，來檢測標靶RNA片段中是否存在與探針同源的序列。雜交過程與南方墨點法一樣是利用DNA與RNA分子高度特異性的原理，可以根據所使用的已知序列探針進行特異性的標靶RNA片段檢測。至於此技術的操作步驟，皆與上述的南方墨點法相似，惟檢測的標的在南方墨點法是DNA，而北方墨點法是RNA。

參考資料

• Madigan, M. T., Martinko, J. M., & Parker, J. (1997). Biology of microorganisms (Vol. 985). Upper Saddle River, NJ: Prentice Hall.