微小 RNA /小分子 RNA

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微小 RNA /小分子 RNA (Micro RNA )
國立臺灣師範大學生命科學系研究助理林如愔

微小 RNA (microRNA, miRNA) 是動植物細胞中的小分子 RNA ,其長度約 21 到 23 個核苷酸,這些 RNA 由核中的染色體 DNA 轉錄出來,但無法進一步轉譯成蛋白質,屬非編碼 RNA 分子 (non-coding RNA molecule),其功能在抑制特定基因的轉錄與轉錄後之表現。

細胞核內的染色體DNA如同寫滿遺傳信息的藍圖,在適當的時候,藍圖會被「複印」成信使 RNA (mRNA) 上的編碼,這過程即是學術上所說的轉錄 (transcription)。信使 RNA 再去指導蛋白質的合成,此過程稱為轉譯 (translation)。微小 RNA 就像殺手,可非常明確地尋找與自己的鹼基編碼能配對結合的目標 mRNA,只要結合上,便能啟動細胞中的降解機制將此目標 mRNA「終結」,使其無法繼續執行其原有的轉譯蛋白質功能。在分子生物學上,這個過程稱為基因靜默 (gene silencing )。

估計人類的基因組中,有 1000 種以上的微小 RNA,它們存在於多種細胞中,且數量豐富,能與近 60% 的哺乳類基因配對。研究發現,真核生物的微小 RNA 具有高度保留性,序列的相似度高,表示這些微小 RNA 是真核生物演化上的共同特徵,同時對真核細胞的基本生理機能是絕對重要的。

儘管動植物都有微小 RNA 系統,研究人員發現其中的細節仍有些差異,例如,植物的微小 RNA 通常與標的 mRNA 之鹼基有接近完美的配對,而動物的微小 RNA 是部分配對即可,在 5’ 端的 6~8 個核苷酸被認為是主要辨識目標的專一性區域。植物的微小 RNA 可以結合在 mRNA 的編碼區 (coding regions)和非編碼區 (untranslated regions),但動物的微小 RNA 通常結合在 mRNA 的 3’ 端尾部-不會轉譯的區域 (3’-untranslated region, 3’-UTR)。此外,微小RNA如何影響基因表現的方式也不盡相同。微小 RNA 在細胞質中會與多種蛋白結合成「RISC 複合體 (RNA-induced silencing complex)」,這些蛋白具有內切酶 (endonuclease) 功能,可在目標mRNA的特定位置切上一刀,因為受傷的 mRNA 在細胞質中缺乏保護,所以很快地就會被細胞分解掉。有些 RISC 複合體並不會傷害目標 mRNA,而是藉由結合而抑制信使 RNA 的轉譯作用,也同樣地有抑制基因表現的效果。由於這些差異,有些科學家認為植物與動物的微小 RNA 系統可能各有演化起源。

1990 年代,微小 RNA 第一次登上檯面,當時還不是很了解它所扮演的角色;到了 2000 年之後,科學界才有共識其為基因調控的重要機制之一。更有趣的是,微小 RNA 與信使 RNA 的關係並非單純的一對一,而是多對多的複雜網絡。微小 RNA 的抑制調控包含促使信使 RNA 的降解 (transcript degradation)、螯合 (sequestering) 和抑制轉譯 (translational suppression) 等。越來越多的研究發現,微小 RNA 不只有抑制基因的表現而已,還有更多的調控機制,包括正向/增強調控 (positive regulation),可活化基因的轉錄或轉譯 (transcriptional and translational activation)。不僅如此,數據指出微小 RNA 的表現量異常與多種疾病相關,如肥胖、癌症、心臟疾病與神經系統病變,如能釐清微小 RNA 在疾病中扮演的角色,未來應用微小 RNA 做臨床治療是指日可待。


參考資料

  1. 大米的逆襲:微小 RNA 操縱了我們的身體嗎? http://pansci.tw/archives/8233
  2. Friedman, RC, Farh, KK, Burge, CB, & Bartel, DP. (2009). Most mammalian mRNAs are conserved targets of microRNAs. Genome Res., 19(1): 92–105.
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  4. Lee, RC, Feinbaum, RL, Ambros, V. (1993). The C. elegansheterochronic gene lin-4 encodes small RNAs with antisense complementarity to lin-14. Cell, 75(5): 843–854.
  5. Lewis, BP, Burge, CB, & Bartel, DP. (2005). Conserved seed pairing, often flanked by adenosines, indicates that thousands of human genes are microRNA targets. Cell, 120(1): 15–20.
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